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Seminario/Taller de Bioinformática y Biología Computacional: Secuenciación de nueva generación (NGS) y Biocomputación de alto rendimiento.

Con la participación  de más de 80 personas se realizó con mucho éxito el Seminario/Taller de Bioinformática de verano: Ultra secuenciación y Biocomputación de alto rendimiento de la Escuela de Medicina (Universidad de Costa Rica), el pasado Enero 2014 en Costa Rica. La actividad fue inaugurado por el Viceministro de Ciencia y Tecnología el Dr Keilor Rojas, quien hizo énfasis en el potencial del tema para el desarrollo del país. La actividad se extendió por 3 días (6, 7 y 8 de Enero) con Talleres de  Bioinformática y Biocomputación en el laboratorio de NIDES de computación (Facultad de Medicina) con estudiantes e investigadores procedentes de CENAT (LANOTEC), MICIT,  TEC, Máster de Bioinformática UCR, Medicina, Microbiología UCR, Biología UCR, Informática UCR, Indromics Bioinformatics, INCIENSA, etc. Los talleres tuvieron temas dirigidos en MPI, MPI4Py, Modelado de estructura atómica, Alineamiento y cuantificación de SNPs, TF y RNA. De parte de SOIBIO participaron la Dra. Marta Bunster (Universidad de Concepción, Chile) y el Dr. Allan Orozco (Universidad de Costa Rica), Coordinador General del evento de formación en Bioinformática.

Programa del evento:

6 de Enero 2014

8:00- 8:15–Apertura del curso: Dr. Keilor Rojas (Viceministro de Ciencia y Tecnología).

Lugar: Auditorio principal de la Facultad de Medicina (Piso Nº2), UCR.

8:15-9:00 am -Introducción a la Secuenciación de Nueva Generación (NGS). Allan Orozco. Máster de Bioinformática y Biología de Sistemas. Universidad de Costa Rica. Director de Indromics Bioinformatics.

9:00 -9:45 am–Computación paralela aplicada a la Bioinformática. Esteban Meneses. University of Pittsburgh (EEUU).

9:45- 10:30 am- Epigenética y Bioinformática: Evolución en el cáncer. Alejandro Fernández. Karoliska Institute (Suecia).

10:30- 11:00 am- Café y aperitivo-

11:00- 11:45 am-. Juan Esquivel. Predicción de estructura terciaria, cuaternaria, interacciones y función. Purdue University (EEUU).

11:45- 12:30 pm- Bioinformática estructural y eficiencia energética molecular. Marta Bunster PhD. Directora del Master en Bioquímica y Bioinformática. Universidad de Concepción, Chile.

12:30 pm- Preguntas y cierre.

Talleres:

6 de Enero 2014

Taller de Bionformática I: Introducción a MPI con MPI4Py Esteban Meneses. University of Pittsburgh (EEUU).

7 Enero 2014

Taller de Bionformática a-II: Modelado de estructura atómica de proteínas basado en secuencias. Juan Esquivel. Purdue University (EEUU).

Taller de Bionformática b-II: Modelación de estructuras de proteínas. Dra. Marta Bunster.

8 de Enero 2014

Taller de Bionformática III: Introducción al NGS (Biosíntesis/illumina), Alineamiento y cuantificación: SNP's, TF y RNA. Alejandro Fernández. Karoliska Institute (Suecia).

Links:

http://ecopolitica.net/costa-rica-posee-gran-potencial-para-el-desarroll...